Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms