Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcc1O35379 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Abcc1O35379 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
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