Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Srsf5O35326 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms