Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Polr1aO35134 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms