Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Scarb2O35114 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Scarb2O35114 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Scarb2O35114 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Scarb2O35114 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Scarb2O35114 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Scarb2O35114 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms