Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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