Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LhbO09108 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LhbO09108 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LhbO09108 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LhbO09108 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LhbO09108 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LhbO09108 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LhbO09108 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LhbO09108 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LhbO09108 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LhbO09108 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LhbO09108 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LhbO09108 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LhbO09108 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LhbO09108 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LhbO09108 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LhbO09108 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LhbO09108 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LhbO09108 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LhbO09108 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LhbO09108 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LhbO09108 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LhbO09108 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LhbO09108 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LhbO09108 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LhbO09108 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LhbO09108 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LhbO09108 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LhbO09108 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LhbO09108 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LhbO09108 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LhbO09108 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LhbO09108 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LhbO09108 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LhbO09108 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LhbO09108 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LhbO09108 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LhbO09108 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LhbO09108 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LhbO09108 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LhbO09108 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LhbO09108 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LhbO09108 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LhbO09108 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LhbO09108 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LhbO09108 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LhbO09108 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LhbO09108 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LhbO09108 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LhbO09108 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LhbO09108 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LhbO09108 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LhbO09108 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LhbO09108 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LhbO09108 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LhbO09108 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LhbO09108 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LhbO09108 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LhbO09108 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LhbO09108 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LhbO09108 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LhbO09108 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LhbO09108 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LhbO09108 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LhbO09108 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms