Protein–RNA interactions for Protein: O08992

Sdcbp, Syntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdcbpO08992 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SdcbpO08992 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdcbpO08992 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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