Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec22bO08547 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms