Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3542K7N6U2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3542K7N6U2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms