Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5225J3QPL3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5225J3QPL3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms