Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20795J3QP49 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20795J3QP49 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms