Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms