Protein–RNA interactions for Protein: J3QNU5

Gm21798, Predicted gene, 21798, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21798J3QNU5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Gm21798J3QNU5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Gm21798J3QNU5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Gm21798J3QNU5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Gm21798J3QNU5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Gm21798J3QNU5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Gm21798J3QNU5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Gm21798J3QNU5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21798J3QNU5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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