Protein–RNA interactions for Protein: J3QNH3

Gm21788, Predicted gene, 21788, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21788J3QNH3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm21788J3QNH3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm21788J3QNH3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm21788J3QNH3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm21788J3QNH3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm21788J3QNH3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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