Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21972J3QN38 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms