Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3415J3QMS8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3415J3QMS8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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