Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
1700014D04RikJ3QMS2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700014D04RikJ3QMS2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms