Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp870J3QMA4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp870J3QMA4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp870J3QMA4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Zfp870J3QMA4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp870J3QMA4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Zfp870J3QMA4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Zfp870J3QMA4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp870J3QMA4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp870J3QMA4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp870J3QMA4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp870J3QMA4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Zfp870J3QMA4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Zfp870J3QMA4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp870J3QMA4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp870J3QMA4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp870J3QMA4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Zfp870J3QMA4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Zfp870J3QMA4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Zfp870J3QMA4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp870J3QMA4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp870J3QMA4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Zfp870J3QMA4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Zfp870J3QMA4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp870J3QMA4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms