Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem200cJ3QK46 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem200cJ3QK46 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms