Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm20828J3KMI7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20828J3KMI7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms