Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn20G5E8X0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms