Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933406M09RikG3XA12 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms