Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pnmal2G3X9N3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnmal2G3X9N3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms