Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim55G3X8Y1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim55G3X8Y1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim55G3X8Y1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim55G3X8Y1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim55G3X8Y1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms