Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd5G3UW60 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd5G3UW60 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms