Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r76F8VQ63 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r76F8VQ63 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r76F8VQ63 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r76F8VQ63 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r76F8VQ63 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms