Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5160F8VPN3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms