Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms