Protein–RNA interactions for Protein: F7AXK2

Gm8871, Predicted pseudogene 8871 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8871F7AXK2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8871F7AXK2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8871F7AXK2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8871F7AXK2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8871F7AXK2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8871F7AXK2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms