Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Crocc2F6XLV1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Crocc2F6XLV1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms