Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21977F6U3N7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21977F6U3N7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms