Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Erich3F6QRE9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Erich3F6QRE9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms