Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms