Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc146E9Q9F7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms