Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf11E9Q6E5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf11E9Q6E5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms