Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DspE9Q557 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DspE9Q557 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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DspE9Q557 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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DspE9Q557 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DspE9Q557 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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DspE9Q557 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DspE9Q557 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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DspE9Q557 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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DspE9Q557 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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DspE9Q557 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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DspE9Q557 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DspE9Q557 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DspE9Q557 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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