Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r56E9Q4U5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r56E9Q4U5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r56E9Q4U5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms