Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc71lE9Q4T4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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