Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3020E9Q3J7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3020E9Q3J7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3020E9Q3J7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3020E9Q3J7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3020E9Q3J7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3020E9Q3J7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms