Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lrp3E9Q1T6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lrp3E9Q1T6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Lrp3E9Q1T6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Lrp3E9Q1T6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Lrp3E9Q1T6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Lrp3E9Q1T6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Lrp3E9Q1T6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Lrp3E9Q1T6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Lrp3E9Q1T6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Lrp3E9Q1T6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Lrp3E9Q1T6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Lrp3E9Q1T6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Lrp3E9Q1T6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Lrp3E9Q1T6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Lrp3E9Q1T6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrp3E9Q1T6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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