Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Gm3893E9Q1I1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Gm3893E9Q1I1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3893E9Q1I1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Gm3893E9Q1I1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Gm3893E9Q1I1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Gm3893E9Q1I1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Gm3893E9Q1I1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Gm3893E9Q1I1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Gm3893E9Q1I1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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