Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1B3

Gm7275, Predicted gene 7275, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7275E9Q1B3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7275E9Q1B3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm7275E9Q1B3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms