Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krt78E9Q0F0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms