Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms