Protein–RNA interactions for Protein: E9PYF4

Lmo7, LIM domain only 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo7E9PYF4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmo7E9PYF4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmo7E9PYF4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms