Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms