Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp54bE9PXC0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms