Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifit3bE9PV48 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms