Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clca3bE9PUL3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clca3bE9PUL3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms